Родился 27 сентября 1912 года в селе Богатырь Великоновоселковского района Донецкой области в бедной крестьянской семье. После армии и после окончания рабфака как особо отличившийся был направлен в 1934 году на дальнейшую учебу в Донецкий индустриальный институт. Окончил в 1939 году со специальностью горного инженера-шахтостроителя. До начала Великой Отечественной войны работал сменным инженером, начальником участка ОКР на шахтах N19 и имени Челюскинцев треста "Сталинуголь". В октябре 1941 года с группой шахтостроителей был эвакуирован в Кизеловский угольный бассейн, где за 10 лет прошел трудовой путь от помощника начальника участка ОКР шахты имени Сталина до главного инженера треста "Кизелуголь". В сентябре 1951 года С. М. Афендиков был направлен на учебу в Академию угольной промышленности в Москву, после окончания в 1953 г. назначен управляющим трестом "Макеевуголь", который возглавлял в течение 10 лет. Развитие добычи угля в Макеевском регионе на основе эффективных решений, на базе прогрессивных технологий постоянно в сфере непосредственной деятельности С. М. Афендикова, настойчиво и планомерно проводящего в жизнь мероприятия по совершенствованию угольного производства. В сентябре 1963 года он был назначен главным инженером управления капитального строительства Донецкого совнархоза, а в декабре 1965 года - главным инженером - заместителем начальника Главного управления капитального строительства Министерства угольной промышленности Украинской ССР, в должности которого работал до перехода в ноябре 1975 года на пенсию. С. М. Афендиков неоднократно избирался депутатом районных и городских Советов народных депутатов, членом секции горного дела Комитета по Государственным премиям Украинской ССР, председателем экзаменационной комиссии Донецкого индустриального (политехнического) института. Он - автор семи изобретений и двадцати пяти научных публикаций. За заслуги в развитии угольной промышленности Савва Михайлович награжден двумя орденами Трудового Красного Знамени, медалями "За трудовую доблесть в Великой Отечественной войне" и "За доблестный труд", знаком "Шахтерская Слава" трех степеней, Почетной грамотой Президиума Верховного Совета Украинской ССР и Министерства угольной промышленности СССР, ему было присвоено звание "Заслуженный Шахтер" и "Заслуженный пенсионер" Украинской СССР. Долголетним и плодотворным трудом он внес значимый вклад в развитие угольной промышленности Украины, своими знаниями, производственным опытом, высочайшей квалификацией, профессионализмом и оперативностью в решении производственных и социальных вопросов, принципиальностью, чутким отношением к труженикам отрасли завоевал большой авторитет, уважение и признательность. С. М. Афендиков скончался в 1998 году, похоронен на кладбище Макеевского шахтоуправления "Холодная Балка".